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新型APOBEC3G-nCas9堿基編輯器的精確性和應(yīng)用價(jià)值

ExMh_zhishexues ? 來源:知社學(xué)術(shù)圈 ? 2020-09-21 17:03 ? 次閱讀
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吉林大學(xué)賴良學(xué)教授和李占軍教授課題組長期致力于利用新型基因編輯技術(shù)構(gòu)建大動(dòng)物模型,主要包括家兔和豬。

最近,該課題組開發(fā)了對(duì)CC context的高特異性新型APOBEC3G-nCas9堿基編輯器,相關(guān)研究成果于2020年8月31日在線發(fā)表于BMC Biology‘ ,題為Precise base editing with CC context-specificity using engineered human APOBEC3G-nCas9 fusions[1]。

圖1.eA3G-BE堿基編輯器具有CCcontext偏好性

傳統(tǒng)的單堿基編輯系統(tǒng)(rA1-BE)由于所用的大鼠胞嘧啶脫氨酶窗口較大,其對(duì)多個(gè)C位點(diǎn)的編輯精確性仍有待提高?;谌薃POBEC3G(hA3G)具有天然的CCcontext偏好性,研究者將hA3G的C端催化結(jié)構(gòu)域與單堿基系統(tǒng)融合,構(gòu)建了新型eA3G-BE堿基編輯系統(tǒng)。該系統(tǒng)在HEK293T細(xì)胞和家兔胚胎中分別獲得了高達(dá)18.3–58.0% 和54.5–92.2%的編輯效率。與傳統(tǒng)的rA1-BE相比,eA3G-BE表現(xiàn)出明顯的CCC>CCC>CC的序列偏好性,從而顯著減少了對(duì)非CCcontext的旁觀者突變(圖1)。同時(shí),研究者將eA3G-BE與SpCas9-NG融合,獲得了eA3G-NG系統(tǒng),將可打靶范圍進(jìn)一步擴(kuò)大到NGNPAM。

圖2.利用eA3G-BEs在家兔中實(shí)現(xiàn)高效CCcontext堿基編輯

進(jìn)一步,研究者利用eA3G-BE和eA3G-NG對(duì)CC context的偏好性,針對(duì)傳統(tǒng)的rA1-BE難以精確實(shí)現(xiàn)的堿基突變位點(diǎn),在家兔中成功精確模擬了人肌萎縮側(cè)索硬化癥Tia1 p.P362L,阿爾茲海默癥Psen1p.P117L和Maptp.P301L等典型的臨床錯(cuò)義突變位點(diǎn)。此外,利用該系統(tǒng)成功構(gòu)建了白化病疾病模型兔,顯著提高了堿基編輯的精確性(圖2)。該新型A3G-BE堿基編輯系統(tǒng)在家兔中的高效應(yīng)用,為相關(guān)疾病的發(fā)病機(jī)制及臨床前研究提供理想的疾病動(dòng)物模型。

值得一提的是,最近來自中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院和美國萊斯大學(xué)的研究人員也開發(fā)了相似的堿基編輯器[2],進(jìn)一步佐證了新型APOBEC3G-nCas9堿基編輯器的精確性和應(yīng)用價(jià)值。

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原文標(biāo)題:新型APOBEC3G-nCas9堿基編輯器提高CC context特異性 | BMC Biology

文章出處:【微信號(hào):zhishexueshuquan,微信公眾號(hào):知社學(xué)術(shù)圈】歡迎添加關(guān)注!文章轉(zhuǎn)載請(qǐng)注明出處。

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